Nhận diện các rủi ro khi thanh tra, kiểm tra thuế năm 2025 và cách phòng ngừa

1. Bức tranh thanh tra thuế năm 2025

Năm 2025, công tác thanh tra – kiểm tra thuế sẽ được cơ quan chức năng siết chặt, đặc biệt với các doanh nghiệp FDI và tập đoàn đa quốc gia. Theo Công văn 2220/TTCP-KHTH (23/10/2024), Tổng cục Thuế sẽ ưu tiên “soi kỹ” 9 nhóm doanh nghiệp có rủi ro cao, bao gồm: ngành dầu khí, điện lực, ngân hàng, bất động sản, thương mại điện tử…; doanh nghiệp lớn chưa từng bị kiểm tra nhiều năm; doanh nghiệp có giao dịch liên kết, chuyển giá, hồ sơ miễn giảm thuế, hoặc có dấu hiệu gian lận, hoàn thuế sai quy định.


Quốc hội thảo luận về dự án Luật Thuế giá trị gia tăng (sửa đổi) tại Kỳ họp thứ 7 (Nguồn: Internet)

Điều này cho thấy việc chuẩn bị hồ sơ, kiểm soát dữ liệu và tuân thủ đúng quy định trở thành yếu tố sống còn, giúp doanh nghiệp tránh rủi ro truy thu và xử phạt.

2. Những rủi ro thường gặp khi thanh tra thuế

Trong quá trình thanh tra, một trong những rủi ro lớn nhất mà doanh nghiệp thường gặp là việc sử dụng hóa đơn đầu vào không hợp lệ. Khi phát hiện, cơ quan thuế sẽ không cho khấu trừ VAT và cũng không chấp nhận chi phí này khi tính thuế TNDN, dẫn đến tăng số thuế phải nộp và có nguy cơ bị xử phạt.

2.1. Hóa đơn đầu vào không hợp lệ:

Một trong những rủi ro phổ biến là việc sử dụng hóa đơn đầu vào từ đơn vị bỏ trốn hoặc không hợp lệ. Khi điều này bị phát hiện, doanh nghiệp sẽ không được khấu trừ VAT và khoản chi phí đó cũng không được tính là hợp lệ, dẫn đến tăng nghĩa vụ thuế và có nguy cơ bị xử phạt.

2.2. Sai lệch giữa sổ sách kế toán và tờ khai thuế

Sai lệch số liệu giữa sổ sách kế toán và các loại tờ khai thuế (VAT, TNDN, TNCN) cũng là một vấn đề đáng lo ngại. Nếu sự chênh lệch này không được phát hiện và điều chỉnh kịp thời, cơ quan thuế có thể nghi ngờ doanh nghiệp gian lận, dẫn đến truy thu và phạt hành chính.

2.3. Giao dịch liên kết và ấn định lợi nhuận

Đối với doanh nghiệp có giao dịch liên kết, rủi ro lớn nhất là không chứng minh được giá giao dịch phù hợp với thị trường. Khi đó, cơ quan thuế có thể ấn định tỷ suất sinh lời để truy thu thuế TNDN, đồng thời khống chế chi phí lãi vay theo quy định.

2.4. Ưu đãi thuế suất sai quy định

Nhiều doanh nghiệp cũng gặp rủi ro khi áp dụng ưu đãi thuế suất. Do thay đổi địa bàn hoặc ngành nghề, mức ưu đãi không còn hiệu lực nhưng doanh nghiệp vẫn áp dụng. Kết quả là khi thanh tra, cơ quan thuế có thể truy thu số thuế chênh lệch cùng tiền phạt.

2.5. Sai phạm thủ tục hành chính

Ngoài ra, thanh tra thuế còn có thể kiểm tra các thủ tục hành chính như việc xuất hóa đơn, lưu trữ chứng từ hay xử lý khiếu nại. Nếu không tuân thủ đúng quy định, doanh nghiệp vừa bị phạt tiền, vừa ảnh hưởng đến hình ảnh chuyên nghiệp.

3. Doanh nghiệp cần làm gì để phòng ngừa rủi ro?


Hạn chế rủi ro là ưu tiên hàng đầu của doanh nghiệp (Nguồn: Internet)

Để hạn chế rủi ro và an tâm hơn trong thanh tra thuế, doanh nghiệp nên:

  • Rà soát hóa đơn đầu vào định kỳ, kiểm tra trên hệ thống hóa đơn điện tử của Tổng cục Thuế.
  • Đối chiếu số liệu kế toán và tờ khai thuế hàng tháng/quý, điều chỉnh kịp thời khi có chênh lệch.
  • Chuẩn bị đầy đủ hồ sơ giao dịch liên kết (hợp đồng, báo cáo Local file, Master file) để chứng minh giá giao dịch hợp lý.
  • Cập nhật chính sách ưu đãi thuế suất theo ngành và địa bàn hàng năm.
  • Hoàn thiện hồ sơ hành chính và phân công nhân sự phụ trách giải trình, sẵn sàng làm việc với cơ quan thuế khi có yêu cầu.

Thanh tra thuế năm 2025 sẽ khắt khe hơn bao giờ hết. Doanh nghiệp cần chủ động rà soát, chuẩn bị hồ sơ và chiến lược quản trị rủi ro thuế toàn diện. Và trong hành trình này, Tavitax luôn là đối tác tin cậy, đồng hành cùng doanh nghiệp bảo vệ lợi ích hợp pháp và nâng cao uy tín trên thị trường.

👉 Liên hệ Tavitax ngay hôm nay để được tư vấn chi tiết và chuẩn bị tốt nhất cho công tác thanh tra, kiểm tra thuế năm 2025.
Số điện thoại: 078 4938687 (Mr. Tuấn)
Email: tuantavitax@tavitax.com