Quyết toán thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) là một trong những quy trình quan trọng trong hoạt động kế toán – thuế của doanh nghiệp. Việc thực hiện quyết toán không chỉ giúp xác định rõ nghĩa vụ tài chính của doanh nghiệp với ngân sách Nhà nước, mà còn là thủ tục bắt buộc trong nhiều trường hợp như giải thể, chuyển đổi loại hình, hoặc thay đổi cơ quan quản lý thuế. Bài viết này sẽ giúp bạn hiểu rõ khi nào cần quyết toán thuế TNDN, thủ tục gồm những bước gì, và cơ quan thuế sẽ kiểm tra trong những trường hợp nào.
1. Quyết toán thuế TNDN là gì?
Hiểu đơn giản, quyết toán thuế TNDN là quá trình kiểm tra toàn diện hồ sơ, sổ sách kế toán của doanh nghiệp sau một giai đoạn hoạt động. Cơ quan thuế sẽ đối chiếu thông tin kê khai, chi phí, doanh thu, lợi nhuận… để xác định số thuế phải nộp thực tế. Từ đó, nếu phát hiện có sai sót hoặc vi phạm, doanh nghiệp sẽ được hướng dẫn khắc phục, điều chỉnh hoặc bị xử lý theo quy định.
Việc quyết toán có thể do doanh nghiệp chủ động đề nghị hoặc do cơ quan thuế thực hiện kiểm tra theo kế hoạch hoặc dấu hiệu rủi ro.
2. Khi nào doanh nghiệp bắt buộc phải thực hiện quyết toán thuế?
Có 3 nhóm tình huống phổ biến buộc doanh nghiệp phải thực hiện quyết toán với cơ quan thuế:
Doanh nghiệp chấm dứt hoạt động kinh doanh:
Khi giải thể, phá sản hoặc chấm dứt mã số thuế, doanh nghiệp bắt buộc phải hoàn tất quyết toán thuế TNDN trước khi chính thức ngừng hoạt động.
Doanh nghiệp tái cơ cấu:
Trường hợp doanh nghiệp thực hiện sáp nhập, chia tách, hợp nhất hoặc chuyển đổi loại hình, cơ quan thuế yêu cầu phải quyết toán đến thời điểm hoàn tất thủ tục chuyển đổi, nhằm xác định rõ nghĩa vụ giữa các bên liên quan.
Doanh nghiệp thay đổi địa điểm dẫn đến thay đổi cơ quan thuế quản lý:
Nếu doanh nghiệp chuyển trụ sở sang địa bàn khác và điều này làm thay đổi cơ quan thuế quản lý trực tiếp, thì cũng cần làm thủ tục quyết toán trước khi chuyển giao.
3. Quy trình thực hiện quyết toán thuế TNDN
Quy trình quyết toán thường được thực hiện theo 3 bước sau:
Bước 1: Gửi công văn đề nghị kiểm tra/quyết toán
Doanh nghiệp chủ động soạn thảo công văn gửi đến Chi cục/Cục thuế quản lý. Nội dung cần ghi rõ: tên doanh nghiệp, mã số thuế, lý do đề nghị (giải thể, sáp nhập, thay đổi địa điểm…), thời điểm đề nghị quyết toán, cam kết hợp tác và cung cấp hồ sơ.
Bước 2: Nộp hồ sơ đầy đủ
Bộ hồ sơ thường bao gồm:
- Báo cáo tài chính các năm liên quan;
- Tờ khai thuế TNDN và phụ lục;
- Tờ khai thuế GTGT, TNCN;
- Báo cáo sử dụng hóa đơn;
- Các tài liệu kế toán khác nếu được yêu cầu.
Bước 3: Cơ quan thuế tiếp nhận và ra quyết định kiểm tra
Nếu hồ sơ hợp lệ, cơ quan thuế sẽ ra quyết định kiểm tra tại trụ sở doanh nghiệp. Quyết định này ghi rõ:
- Thời gian kiểm tra;
- Phạm vi nội dung;
- Tên đoàn kiểm tra.
4. Các trường hợp cơ quan thuế tiến hành kiểm tra, quyết toán
Không chỉ khi doanh nghiệp đề nghị, cơ quan thuế còn chủ động thực hiện kiểm tra/quyết toán trong các trường hợp sau (dẫn theo Quyết định 970/QĐ-TCT ngày 14/07/2023):
- Khi có dấu hiệu vi phạm pháp luật về thuế;
- Khi doanh nghiệp có yêu cầu hoàn thuế;
- Theo kế hoạch kiểm tra định kỳ hoặc theo chuyên đề ngành, khu vực;
- Theo kiến nghị của Kiểm toán Nhà nước, Thanh tra Chính phủ hoặc các cơ quan chức năng;
- Khi doanh nghiệp có sự thay đổi lớn về cấu trúc như chia, tách, sáp nhập, chuyển đổi loại hình, giải thể, chấm dứt mã số thuế;
- Trong trường hợp bị tố cáo, hoặc có chỉ đạo từ lãnh đạo ngành thuế, cơ quan thuế cũng có thể thực hiện kiểm tra đột xuất.
5. Kết luận
Quyết toán thuế TNDN là trách nhiệm quan trọng và không thể thiếu đối với mọi doanh nghiệp, đặc biệt khi có thay đổi lớn về pháp lý hoặc tổ chức. Nắm vững các trường hợp bắt buộc, hiểu đúng quy trình và chuẩn bị đầy đủ hồ sơ là cách tốt nhất để doanh nghiệp tránh rủi ro về pháp lý, tránh bị xử phạt và thể hiện sự minh bạch trong quản trị tài chính.




